Mentype® DIPscreen

Maßgeschneidertes Chimärismusmonitoring

Features

Hochinformative Loci zur spezifischen Differenzierung von Genotypen
Geringer DNA-Einsatz für sensitive Ergebnisse ≥ 2 %
Ermöglicht Hochdurchsatz-Genotypisierung sowie Monitoring

Das Kit Mentype^® DIPscreen ist das optimale Produkt für den ökonomischen Start in die sensitive Chimärismusanalyse. Das Kit wird für die initiale Genotypisierung von Spender- und Empfängerproben genutzt und kann anschließend für ein Chimärismusmonitoring mit bis zu 2 % Sensitivität genutzt werden. Eine hochsensitive Chimärismusanalyse kann zudem entweder mit den qPCR Assays Mentype^® DIPquant oder mit dem breit anwendbaren digital PCR-Kits der Mentype^® DigitalQuant Reihe (RUO) erfolgen. Diese Kombinationen ermöglichen eine auf Ihre Anforderungen abgestimmte, flexible und zuverlässige Chimärismusanalyse.

Biomarker

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FAM-Panel

DIP Locus: AM X, AM Y, HLD106, HLD70, HLD84, HLD103, HLD104, HLD116, HLD112, HLD307, HLD310, HLD110, HLD133, HLD79, HLD105,HLD140, HLD163

‍Chromosomale Lokalisation: Xp22.1-22.3, Yp11.2, 16q13, 6q16.1, 8q24.12, 12q23.1, 13q32.1, 18p11.22, 17p12, Xp11.23, 2p22.3, 16q22.1, 3p22.1, 7q31.2, 14q24.3, 3q23, 12q24.31

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BTG Panel

DIP Locus: HLD91, HLD23, HLD88, HLD101, HLD67, HLD301, HLD53, HLD97, HLD152, HLD128, HLD134, HLD305

‍Chromosomale Lokalisation:11q14.1, 18p11.32, 9q22.33, 15q26.1, 5q33.3, 17q21.32, 3q22.1, 13q13.1, 16p13.2, 1q31.3, 5q11.2, 20q11.22

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BTY Panel

DIP Locus: HLD48, HLD114, HLD304, HLD131, HLD38, HLD82

‍Chromosomale Lokalisation: 2q11.2, 17p13.2, 9q34.3, 7q36.2, 1q32.2, 7q21.3

Produktspezifikationen

Panel
33 DIP Loci + Amelogenin

Reaktionen
1 Multiplex PCR Reaktion pro Probe

PCR-Kontrollen
2 enthalten (PC, NTC)

Probeneinsatz
1-2 ng gDNA aus periphärem Vollblut

Sensitivität
≥ 2 %

Bearbeitungszeit
~ 4 h nach Nukleinsäurevorbereitung

Nachweis
Qualitative Genotypisierung, Semiquantitative Chimärismusanalyse

Zu verwenden mit
Standard Thermocycler + Thermo Fisher Genetic Analyzer

Datenanalyse
ChimerisMonitor (RUO), GeneMapper^TM ID/ ID-X + spezifische Templates

Wissenschaftlicher Hintergrund

Die Analyse des molekularen Chimärismus ist entscheidend, um das Anwachsen des Stammzelltransplantates zu überwachen bzw. um eine drohende Abstoßungsreaktion frühzeitig zu erkennen. Die molekulare Chimärismusanalyse kann über diverse DNA-Sequenzmotive erfolgen. Großen Vorteil bieten hier die sogenannten Insertions/Deletions -Polymorphismen (DIPs/INDELs). Im Vergleich zu anderen DNA-Sequenzmotiven führt die enzymkatalysierte Amplifikation dieser Loci nicht zur Ausbildung von „stutter-peak“ Artefakten, außerdem eignen sich DIP-Polymorphismen sehr gut für die quantitative Analyse mittels qPCR-Technologie. Eine auf DIPs basierte Diagnostik kann somit der eindeutigen und hochsensitiven Überwachung des Chimärismusstatus gerecht werden.

Produktreferenzen

Ferreras, C. et al. Results of phase 2 randomized multi-center study to evaluate the safety and efficacy of infusion of memory T cells as adoptive therapy in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pneumonia and/or lymphopenia (RELEASE NCT04578210). Cytotherapy 26, 25-35, https://doi.org/10.1016/j.jcyt.2023.10.002 (2024)
Al-Akioui Sanz, K. et al. Familial CD45RA– T cells to treat severe refractory infections in immunocompromised patients. Front. Med. 10. https://doi.org/10.3389/fmed.2023.1083215 (2023)
Huyveneers, L. E. P. et al. Autopsy Study Defines Composition and Dynamics of the HIV-1 Reservoir after Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation with CCR5D32/D32 Donor Cells. Viruses 14. https://doi.org/10.3390/v14092069 (2022)
Pérez-Martínes, A. et al. Phase I dose-escalation single centre clinical trial to evaluate the safety of infusion of memory T cells as adoptive therapy in COVID-19 (RELEASE). EClinicalMedicine 39. https://doi.org/10.1016/j.eclinm.2021.101086 (2021)
Fortschegger, M. et al. Detection and Monitoring of Lineage-Specific Chimerism by Digital Droplet PCR-Based Testing of Deletion/Insertion Polymorphisms. Biol Blood Marrow Transplant 26, 1218-1224, https://doi.org/10.1016/j.bbmt.2020.02.016 (2020)
Gómez-García, L. M. et al. A phase II clinical trial of infusing haploidentical K562-mb-IL15-41BBL activated and expanded Natural Killer cells as consolidation therapy for pediatric acute myeloblastic leukemia. ESS Open Archive. DOI: 10.22541/au.160192968.85891275/v1 (2020)
Navarro-Bailón, A et al. Short Tandem Repeats (STRs) as Biomarkers for the Quantitative Follow-Up of Chimerism after Stem Cell Transplantation: Methodological Considerations and Clinical Application. Genes 11, 993. https://doi.org/10.3390/genes11090993 (2020)
Cechova, H. et al. Suitable Molecular Genetic Methods for the Monitoring of Cell Chimerism. Rare Diseases. IntechOpen. http://dx.doi.org/10.5772/intechopen.88436 (2019)
Salgado, M. et al. Mechanisms That Contribute to a Profound Reduction of the HIV-1 Reservoir After Allogeneic Stem Cell Transplant. Annals of Internal Medicine 169, 674-683. https://doi.org/10.7326/M18-0759 (2018)
Sellmann, L. et al. Diagnostic value of highly-sensitive chimerism analysis after allogeneic stem cell transplantation. Bone Marrow Transplant 53, 1457-1465. https://doi.org/10.1038/s41409-018-0176-7 (2018)
Navarro-Bailón, A. et al. A Novel Quantitative PCR Approach Targeting Insertion/Deletion Polymorphisms (Indel-PCR) for Chimerism Quantification: Finally High Sensitivity and Quantification Capacity Together. Blood 126, 4227. https://doi.org/10.1182/blood.V126.23.4277.4277 (2015)
Willasch, A. M. et al. Monitoring of Hematopoietic Chimerism after Transplantation for Pediatric Myelodysplastic Syndrome: Real-Time or Conventional Short Tandem Repeat PCR in Peripheral Blood or Bone Marrow? Biol Blood Marrow Transplant 20, 1918-1925. https://doi.org/10.1016/j.bbmt.2014.07.030 (2014)