Mentype® DIPquant

Hoch-sensitives Chimärismusmonitoring

Features

Frühzeitige Erkennung eines imminenten Rezidivs
Nachweis spezifischer Allelanteile zwischen 0,05 % und 12,5 % Chimärismus
Auf Standard-qPCR Systemen anwendbar

Nach einer initialen Genotypisierung ermöglicht Mentype^® DIPquant eine sensitive Chimärismusdiagnostik, welche zum Nachweis kleinster Veränderungen im Chimärismusstatus des Patienten geeignet ist. So kann ein Rezidiv früher erkannt werden als unter Verwendung weniger empfindliche Methoden. Mentype^® DIPquant ist das Tool für die hochsensitive Chimärismusanalyse, wenn der DNA-Einsatz nicht limitierend ist. Sollte die verfügbare DNA-Menge begrenzt sein, so ist die semi-quantitative Chimärismusdiagnostik mit Mentype^® DIPscreen über breitere Chimärismusbereiche möglich. Die Kombination aus Mentype^® DIPscreen und Mentype^® DIPquant deckt damit alle Bereiche der Diagnostik für die Routineanalyse ab.

Biomarker

Insertions-Deletions Polymorphismen (DIPs oder INDELs), Referenzgen

Produktspezifikationen

Panel
56 allelspezifische Singleplex-Assays, 1 Referenzassay

Reaktionen
3 allelspezifische Assays + Referenzassay in Duplikaten (8 Reaktionen pro Probe)

PCR-Kontrollen
2 (PC durch bestehende Proben, NTC)

Probeneinsatz
250 ng gDNA aus periphärem Vollblut

Sensitivität
≥ 0,05 %

Bearbeitungszeit
~ 1,5 h nach Nukleinsäurevorbereitung

Nachweis
Relative Quantifizierung

Zu verwenden mit
Standard qPCR-Cycler (FAM)

Datenanalyse
ChimerisMonitor (RUO), Cycler-spezifische Software, ∆∆Ct Berechnung

Wissenschaftlicher Hintergrund

Die Analyse des molekularen Chimärismus nach allogener Knochenmark- und Blutstammzelltransplantation ist entscheidend, um das Anwachsen des Transplantates zu überwachen bzw. um eine drohende Abstoßungsreaktion frühzeitig zu erkennen. Die molekulare Chimärismusanalyse erfolgt über den Nachweis individualspezifischer Deletions / Insertions DNA-Polymorphismen, welche im Vergleich zu anderen DNA-Sequenzmotiven sehr gut für die Analyse mittels allel-spezifischer qPCR geeignet sind.

Im Anschluss an die Identifizierung informativer DIP-Loci des Patienten und des Spenders mit dem CE-IVD Mentype^® DIPscreen Kit kann mit den entsprechenden Mentype^® DIPquant Singleplex-Assays die quantitative Chimärismusanalyse erfolgen. Das flexible Assayformat erlaubt sowohl die Analyse einzelner Proben als auch großer Probenmengen mit minimalem Materialaufwand. Da die hohe Sensitivität der qPCR methodenbedingt mit einer begrenzten Genauigkeit im Bereich des gemischten Chimärismus verbunden ist, wird empfohlen, Proben mit gemischtem Chimärismus mittels des Mentype^® DIPscreen Kits zu analysieren (Leitlinie zur allogenen Stammzelltransplantation der Deutschen Arbeitsgemeinschaft für Knochenmark- und Blutstammzelltransplantation (DAG-KBT); Bader et al. 2016).

Produktreferenzen

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